Caracterización de ADN de Leucocoryne sp de zonas áridas: variaciones por tejidos y especies.

Vol. 31 N°3. Diciembre, 2025. / Artículos

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Palabras clave:
Leucocoryne
Extracción de ADN
Secuenciación
Desierto florido
Cómo citar
González Campos, J., Hernández Cartes, J., Yaojia, M., Quintana Garrido, A., Córdova Molina, R., Vidal Toro, R., & Vera Castro, T. (2025). Caracterización de ADN de Leucocoryne sp de zonas áridas: variaciones por tejidos y especies. Ciencia & Investigación Forestal, 31(3), 33–43. https://doi.org/10.52904/0718-4646.2025.646

Contenido principal del artículo

Jorge González Campos
Instituto Forestal, sede Biobío. Concepción, Chile.
https://orcid.org/0009-0003-0778-3255
José Hernández Cartes
Instituto Forestal, sede Diaguitas. La Serena, Chile.
Ma Yaojia
Chilquinta Transmisión S.A., Gerencia General.
Andrés Quintana Garrido
Rodrigo Córdova Molina
Ronald Vidal Toro
Chilquinta Transmisión S.A., Subgerencia de Medio Ambiente y Comunidades
Tamara Vera Castro
Instituto Forestal, sede Biobío. Concepción, Chile.
DOI: https://doi.org/10.52904/0718-4646.2025.646

Resumen

El estudio explora la extracción de ADN de alto peso molecular desde tejidos de cinco especies de Leucocoryne, un género endémico de Chile. Utilizando el método basado en fluorescencia, se evaluó la cantidad y calidad del ADN extraído de flores, hojas, raíces, tallos y bulbos. Los resultados destacan que las flores y los bulbos presentan las mayores concentraciones, aunque con variabilidad significativa entre especies y tejidos. La calidad del ADN fue más consistente en hojas y bulbos, mientras que los tallos presentaron las peores condiciones para aplicaciones de secuenciación de lecturas largas. Este trabajo ofrece una base valiosa para futuros estudios genómicos en Leucocoryne y en otras plantas de características similares.

Referencias

Araneda, L., Salas, P. & Mansur, L. (2004). Chromosome numbers in the Chilean endemic genus Leucocoryne (Huilli). Journal of the American Society for Horticultural Science, 129(1), 77–80. https://doi.org/10.21273/JASHS.129.1.0077

Contreras, R., Aguayo, F., Guerra, A., Tapia, F. & Porcile, V. (2018). Genetic characterization of centennial olive trees from northern Chile: The case of extra virgin olive oil from Huasco in the process of designation of origin. Chilean journal of agricultural & animal sciences 34:126 - 139. https://doi.org/10.4067/s0719-38902018005000402

Contreras, R., Van den Brink, L., Sepúlveda, B., Aguayo, F. & Porcile, V. (2020). Phylogenetic relationships of plant species from the flowering desert of the Atacama Region. Bol. Latinoam Caribe Plant Med Aromat, 19 (3): 300-313.

Cosgrove, D.J. (2024). Structure and growth of plant cell walls. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 25(5): 340-358. https://doi.org/10.1038/s41580-023-00691-y

De la Cuadra, C., Vidal, A.K., Lefimil, S. & Mansur, L. (2016). Temperature effect on seed germination in the genus Leucocoryne (Amaryllidaceae). HortScience, 51(4): 412-415. https://doi.org/10.21273/HORTSCI.51.4.412

Doyle. J.J. & Doyle, J.L. (1987). A Rapid DNA Isolation Procedure for Small Quantities of Fresh Leaf Tissue. Phytochemical Bulletin, 19(1): 11-15.

Espinosa, E., Bautista, R., Larrosa, R. & Plata, O. (2024). Advancements in long-read genome sequencing technologies and algorithms. Genomics, 110842. Contents lists available at ScienceDirect Genomics journal homepage: www.elsevier.com/locate/ygeno https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2024.110842

Glade-Vargas, N.S., Rojas, C., Jara-Arancio, P., Vidal, P., Arroyo, M.T.K. & Hinojosa, L.F. (2021). Biogeography of Argylia D. Don (Bignoniaceae): Diversification, Andean Uplift and Niche Conservatism. Front. Plant Sci. 12:724057. https://doi.org/10.3389/fpls.2021.724057

Jara-Arancio, P., Jara-Seguel, P., Palma-Rojas, C., Arancio, G. & Moreno, R. (2012). Karyological study in fifteen Leucocoryne taxa (Alliaceae). Biologia 67(2): 289-295, https://doi.org/10.2478/s11756-012-0001-5

Jara-Arancio, P., Arroyo, M. Guerrero, P., Hinojosa, L. Arancio, G. & Méndez, M. (2014). Phylogenetic perspectives on biome shifts in Leucocoryne (Alliaceae) in relation to climatic niche evolution in western South America. Journal of Biogeography, N° 41. Pp: 328-338. https://doi.org/10.1111/jbi.12186

Jin, S., Han, Z., Hu, Y., Si, Z., Dai, F., He, L., Cheng, Y. et al. (2023). Structural variation (SV)-based pan-genome and GWAS reveal the impacts of SVs on the speciation and diversification of allotetraploid cottons. Molecular Plant. https://doi.org/10.1016/j.molp.2023.02.004

Mansur, L., Gonzalez, M., Rojas, I. & Salas, P. (2004). Self-incompatibility in the Chilean Endemic Genus Leucocoryne Lindley. Journal of the American Society for Horticultural Science, 129(6): 836–838. https://doi.org/10.21273/JASHS.129.6.0836

Milavec, M., Cleveland, M.H., Bae, K., Wielgosz, R.I., Vonsky, M. & Huggett, J.F. (2021). Metrological framework to support accurate, reliable, and reproducible nucleic acid measurements. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 414(2): 791–806. https://doi.org/10.1007/s00216-021-03712-x

Mondragon-Jacobo, C., Doudareva, N. & Bordelon, B.P. (2000). DNA extraction from several cacti. Hort. Science, 35(6): 1124–1126. https://doi.org/10.21273/HORTSCI.35.6.1124

QIAGEN. (2024). DNeasy® Plant Handbook: DNeasy Plant Mini Kit, DNeasy Plant Maxi Kit, DNeasy 96 Plant Kit. Para la purificación de ADN celular total de células y tejidos vegetales o hongos. En: https://www.qiagen.com

Rodríguez, R., Marticorena, C., Alarcón, D., Baeza, C., Cavieres, L., Finot, V.L., Fuentes, N. et al. (2018). Catálogo de las plantas vasculares de Chile. Gayana Botánica 75(1): 1-430. https://doi.org/10.4067/S0717-66432018000100001

Russo, A., Mayjonade, B., Frei, D., Potente, G., Kellenberger, R.T., Frachon, L., Copetti, D. et al. (2022). Low-Input High-Molecular-Weight DNA Extraction for Long-Read Sequencing from Plants of Diverse Families. Frontiers in Plant Science,13:883897. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.883897

Salas, P. & Mansur, L. (2004). Gene Flow between parents with different ploidy levels in a natural population of Leucocoryne Lindley. Journal of the American Society for Horticultural Science, 129(6): 836-838. https://doi.org/10.21273/JASHS.129.6.0833

Sassone, A.B., López, A., Hojsgaard, D.H. & Giussani, L.M. (2018). A novel indicator of karyotype evolution in the tribe Leucocoryneae (Allioideae, Amaryllidaceae). Journal of Plant Research, 131(2): 211-223. https://doi.org/10.1007/s10265-017-0987-4

Saxena, R.K., Edwards, D. & Varshney, R.K. (2014). Structural variations in plant genomes. Briefings in Functional Genomics, 13(4): 296-307. https://doi.org/10.1093/bfgp/elu016

Souza, G., Crosa, O., Speranza, P. & Guerra, M. (2016). Phylogenetic relations in tribe Leucocoryneae (Amaryllidaceae, Allioideae) and the validation of Zoellnerallium based on DNA sequences and cytomolecular data. Botanical Journal of the Linnean Society, N° 182. Pp: 811-824. https://doi.org/10.1111/boj.12484

Yuan, Y., Bayer, P.E., Batley, J. & Edwards, D. (2021). Current status of structural variation studies in plants. Plant Biotechnology Journal, 19(10): 2153-2163. https://doi.org/10.1111/pbi.13646

Zerpa-Catanho, D., Zhang, X., Song, J., Hernandez, A.G. & Ming, R. (2021). Ultra-long DNA molecule isolation from plant nuclei for ultra-long read genome sequencing. STAR Protocols, 2(1):100343. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100343

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